Arlo Beauregard, một cậu bé nửa người nửa cá sấu, được đặt trong cống thoát nước thải ở thành phố New York ngay sau khi chào đời, rồi cậu bị dòng nước cuốn trôi ra đại dương đến một đầm lầy xa xôi, nơi cậu được một người phụ nữ tên Edmée nhận nuôi. Trở thành một thiếu niên, Arlo mong muốn được giao lưu với mọi người nhưng sợ ngoại hình cá sấu của mình sẽ không được xã hội chấp nhận. Vào ngày sinh nhật thứ mười lăm của cậu, Edmée đưa cho Arlo chiếc vòng tay có được từ lúc cậu mới sinh và tiết lộ với Arlo rằng cậu đến từ thành phố New York.

Arlo quyết định đi đến thành phố này để tìm cha ruột của mình – Ansel Beauregard. Trong chuyến đi, Arlo bị phát hiện bởi một người có liên hệ với hai thợ săn cá sấu Ruff và Stucky. Sau khi những người thợ săn tìm thấy cậu, Arlo được cô gái khổng lồ Bertie cứu giúp. Tại một câu lạc bộ đấu vật, cả hai gặp Furlecia, Tony Tí Hon và Alia, và họ đồng ý đưa Arlo và Bertie đến New York sau khi cậu giúp họ giải cứu người bạn Marcellus của mình khỏi một thủy cung.

Đến New York, cả nhóm biết được doanh nhân Ansel Beauregard đang lên kế hoạch xây dựng lại Bãi bờ bên bờ biển – một khu ổ chuột gần bờ biển của thành phố. Tiếp cận Ansel Beauregard, Arlo được Ansel từ chối nhận cậu làm con trai, nhưng Arlo không đồng ý. Thất vọng và đơn độc, Arlo đi vào một cống thoát nước và sau đó được những người bạn mình tìm thấy tại chính Bãi bờ bên bờ biển. Những người bạn giúp Arlo hiểu ra rằng bất kể cậu có khác biệt như thế nào đi chăng nữa, những sai sót của cậu chính là điều khiến cậu trở thành chính của mình.

Tại buổi Met Gala tối hôm đó, Arlo và nhóm bạn đột nhập sự kiện nhưng bị Ruff, Stucky và quái thú đi cùng họ bí mật theo dõi. Sau đó, Arlo làm gián đoạn buổi dạ tiệc và Ansel cố gắng nói cho cậu biết sự thật. Tuy nhiên, Arlo sau đó bị Ruff và Stucky bắt cóc. Sau khi giải cứu Arlo, Ansel tiết lộ với khán giả rằng ông là một người chim và cũng là cha ruột của Arlo. Khi xưa ông từ bỏ cậu để che giấu danh tính người chim của mình và ông muốn Arlo tha thứ cho mình và bắt đầu lại mối quan hệ. Vui mừng, Arlo ôm cha và tha thứ cho ông, nhưng từ chối sống với ông để ở cùng những người bạn của mình. Ansel quyết định để Arlo và nhóm bạn chuyển đến và xây dựng lại khu Bãi bờ bên bờ biển, và Arlo chấp nhận đây chính là nơi cậu thực sự thuộc về. Ở cảnh danh đề, Edmée nhận được một tấm bưu thiếp và bà biết được về cuộc sống mới của Arlo.